Her şeyden önce karaciğer hastalıklarında kontrendikedirler.
Organ iyi değilse karoteni ememez. Mide veya bağırsak ülseri ve ince bağırsak duvarlarının iltihabı olan enterit de kontrendikasyonlar arasındadır.
Havuç seçerken yumuşak ve şişkin olmamasına, üzerinde leke ve çatlak olmamasına (bu ortasının bozuk olduğu anlamına gelir) dikkat edin. Üst kısımları çok kalınsa kök sebzenin sert olması muhtemeldir.
